Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms