Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad9Q9JIW5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms