Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp1r3fQ9JIG4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp1r3fQ9JIG4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms