Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RabggtaQ9JHK4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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