Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms