Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hipk3Q9ERH7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms