Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms