Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER97

Ngb, Neuroglobin, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgbQ9ER97 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NgbQ9ER97 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NgbQ9ER97 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NgbQ9ER97 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NgbQ9ER97 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NgbQ9ER97 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NgbQ9ER97 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NgbQ9ER97 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NgbQ9ER97 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NgbQ9ER97 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NgbQ9ER97 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NgbQ9ER97 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NgbQ9ER97 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NgbQ9ER97 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NgbQ9ER97 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NgbQ9ER97 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NgbQ9ER97 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NgbQ9ER97 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NgbQ9ER97 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NgbQ9ER97 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NgbQ9ER97 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NgbQ9ER97 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NgbQ9ER97 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NgbQ9ER97 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NgbQ9ER97 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NgbQ9ER97 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NgbQ9ER97 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms