Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms