Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Clstn2Q9ER65 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms