Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col4a3bpQ9EQG9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms