Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgap1Q9EPJ9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgap1Q9EPJ9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgap1Q9EPJ9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgap1Q9EPJ9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgap1Q9EPJ9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgap1Q9EPJ9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgap1Q9EPJ9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgap1Q9EPJ9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgap1Q9EPJ9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgap1Q9EPJ9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgap1Q9EPJ9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgap1Q9EPJ9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgap1Q9EPJ9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgap1Q9EPJ9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgap1Q9EPJ9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgap1Q9EPJ9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgap1Q9EPJ9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgap1Q9EPJ9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgap1Q9EPJ9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgap1Q9EPJ9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms