Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pak1ip1Q9DCE5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pak1ip1Q9DCE5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pak1ip1Q9DCE5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pak1ip1Q9DCE5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pak1ip1Q9DCE5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pak1ip1Q9DCE5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pak1ip1Q9DCE5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pak1ip1Q9DCE5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pak1ip1Q9DCE5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pak1ip1Q9DCE5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pak1ip1Q9DCE5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pak1ip1Q9DCE5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pak1ip1Q9DCE5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pak1ip1Q9DCE5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pak1ip1Q9DCE5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pak1ip1Q9DCE5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pak1ip1Q9DCE5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pak1ip1Q9DCE5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pak1ip1Q9DCE5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pak1ip1Q9DCE5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pak1ip1Q9DCE5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pak1ip1Q9DCE5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pak1ip1Q9DCE5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pak1ip1Q9DCE5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pak1ip1Q9DCE5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms