Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Xab2Q9DCD2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms