Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC7

Prkar1a, cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1aQ9DBC7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkar1aQ9DBC7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prkar1aQ9DBC7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prkar1aQ9DBC7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prkar1aQ9DBC7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prkar1aQ9DBC7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms