Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DAE8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DAE8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAE8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAE8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DAE8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DAE8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DAE8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DAE8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DAE8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DAE8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DAE8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DAE8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DAE8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DAE8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DAE8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms