Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sgf29Q9DA08 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms