Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Speer4bQ9D9F7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms