Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9C7

Uncharacterized protein C3orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9C7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D9C7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D9C7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D9C7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D9C7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D9C7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D9C7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D9C7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D9C7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D9C7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D9C7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D9C7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D9C7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D9C7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D9C7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D9C7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D9C7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D9C7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D9C7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D9C7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D9C7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D9C7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D9C7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D9C7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D9C7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D9C7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D9C7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D9C7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D9C7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D9C7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D9C7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D9C7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D9C7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D9C7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D9C7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D9C7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9C7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D9C7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms