Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms