Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SlirpQ9D8T7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SlirpQ9D8T7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SlirpQ9D8T7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SlirpQ9D8T7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SlirpQ9D8T7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SlirpQ9D8T7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SlirpQ9D8T7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SlirpQ9D8T7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SlirpQ9D8T7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SlirpQ9D8T7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms