Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms