Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rep15Q9D7T1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rep15Q9D7T1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rep15Q9D7T1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rep15Q9D7T1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rep15Q9D7T1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rep15Q9D7T1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rep15Q9D7T1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rep15Q9D7T1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rep15Q9D7T1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rep15Q9D7T1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rep15Q9D7T1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rep15Q9D7T1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rep15Q9D7T1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rep15Q9D7T1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rep15Q9D7T1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rep15Q9D7T1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rep15Q9D7T1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rep15Q9D7T1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Rep15Q9D7T1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Rep15Q9D7T1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Rep15Q9D7T1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Rep15Q9D7T1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rep15Q9D7T1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rep15Q9D7T1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rep15Q9D7T1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rep15Q9D7T1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rep15Q9D7T1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rep15Q9D7T1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rep15Q9D7T1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rep15Q9D7T1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rep15Q9D7T1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rep15Q9D7T1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rep15Q9D7T1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rep15Q9D7T1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rep15Q9D7T1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rep15Q9D7T1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rep15Q9D7T1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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