Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms