Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms