Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpap3Q9D706 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpap3Q9D706 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpap3Q9D706 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpap3Q9D706 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpap3Q9D706 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpap3Q9D706 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpap3Q9D706 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpap3Q9D706 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpap3Q9D706 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpap3Q9D706 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpap3Q9D706 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpap3Q9D706 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpap3Q9D706 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms