Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MsraQ9D6Y7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms