Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc52a3Q9D6X5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc52a3Q9D6X5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms