Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc9bQ9D6E4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms