Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spsb1Q9D5L7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms