Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms