Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms