Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syce1Q9D495 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms