Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snx29Q9D3S3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx29Q9D3S3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snx29Q9D3S3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snx29Q9D3S3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snx29Q9D3S3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snx29Q9D3S3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snx29Q9D3S3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snx29Q9D3S3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx29Q9D3S3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx29Q9D3S3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx29Q9D3S3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx29Q9D3S3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx29Q9D3S3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx29Q9D3S3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx29Q9D3S3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx29Q9D3S3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx29Q9D3S3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx29Q9D3S3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx29Q9D3S3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx29Q9D3S3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx29Q9D3S3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx29Q9D3S3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx29Q9D3S3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms