Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms