Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2P4

Urm1, Ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urm1Q9D2P4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urm1Q9D2P4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Urm1Q9D2P4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Urm1Q9D2P4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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