Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms