Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbed3Q9D0L1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbed3Q9D0L1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
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