Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtf2e1Q9D0D5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms