Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cmss1Q9CZT6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmss1Q9CZT6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmss1Q9CZT6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmss1Q9CZT6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmss1Q9CZT6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmss1Q9CZT6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmss1Q9CZT6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmss1Q9CZT6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmss1Q9CZT6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmss1Q9CZT6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmss1Q9CZT6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmss1Q9CZT6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmss1Q9CZT6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmss1Q9CZT6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmss1Q9CZT6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmss1Q9CZT6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmss1Q9CZT6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmss1Q9CZT6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmss1Q9CZT6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmss1Q9CZT6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmss1Q9CZT6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmss1Q9CZT6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms