Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ91

Srfbp1, Serum response factor-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srfbp1Q9CZ91 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srfbp1Q9CZ91 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srfbp1Q9CZ91 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srfbp1Q9CZ91 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srfbp1Q9CZ91 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srfbp1Q9CZ91 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srfbp1Q9CZ91 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srfbp1Q9CZ91 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srfbp1Q9CZ91 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srfbp1Q9CZ91 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srfbp1Q9CZ91 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srfbp1Q9CZ91 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Srfbp1Q9CZ91 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srfbp1Q9CZ91 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srfbp1Q9CZ91 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srfbp1Q9CZ91 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srfbp1Q9CZ91 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srfbp1Q9CZ91 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srfbp1Q9CZ91 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms