Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdhd3Q9CYW4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms