Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Bud23Q9CY21 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Bud23Q9CY21 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Bud23Q9CY21 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Bud23Q9CY21 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bud23Q9CY21 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Bud23Q9CY21 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bud23Q9CY21 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bud23Q9CY21 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bud23Q9CY21 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bud23Q9CY21 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bud23Q9CY21 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bud23Q9CY21 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bud23Q9CY21 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Bud23Q9CY21 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bud23Q9CY21 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bud23Q9CY21 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bud23Q9CY21 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bud23Q9CY21 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bud23Q9CY21 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bud23Q9CY21 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bud23Q9CY21 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bud23Q9CY21 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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