Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
3100002H09RikQ9CXW6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms