Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nip7Q9CXK8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms