Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Sgo1Q9CXH7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Sgo1Q9CXH7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Sgo1Q9CXH7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Sgo1Q9CXH7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Sgo1Q9CXH7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Sgo1Q9CXH7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Sgo1Q9CXH7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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