Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms