Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx10Q9CWT3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Snx10Q9CWT3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx10Q9CWT3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx10Q9CWT3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx10Q9CWT3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx10Q9CWT3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx10Q9CWT3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx10Q9CWT3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms