Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms