Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a2Q9CTG6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms